Инструкция по настройке работы через прокси
-  Установите нашу пропатченную версию cvs (http://www.lincvs.org, раздел Download/CVS).
-  Пропатченная версия должна быть в путях.
-  Откройте диалог настроек (LinCVS/Options/Settings/CVS Details) и добавьте нечто наподобие следующего: 
 
     my.cvstarget.server::my.proxy.server:proxyport
Всё!